由斯克里普斯研究公司(Scripps Research)的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)團(tuán)隊(duì)發(fā)明了一種新的基因組學(xué)技術(shù)，用于追蹤罕見遺傳疾病的原因。
研究人員在《科學(xué)》雜志上報(bào)告了這項(xiàng)技術(shù)，它利用了這樣一個(gè)事實(shí)，即人們幾乎繼承了每個(gè)基因的兩個(gè)拷貝或“等位基因”，一個(gè)來自母親，一個(gè)來自父親。新方法比較了整個(gè)基因組中母本和父本等位基因的活性水平，并檢測了等位基因的活性何時(shí)位于正常范圍之外足夠遠(yuǎn)的范圍，從而可以說是疾病的可能原因。
研究人員通過使用這項(xiàng)技術(shù)揭示了罕見的肌營養(yǎng)不良患者的致病基因，從而證明了他們的技術(shù)。
將這種方法添加到我們的工具箱中應(yīng)該可以使我們在某些標(biāo)準(zhǔn)方法失敗的情況下檢測出罕見遺傳病的原因。”
Mohammadi開始在紐約基因組中心和哥倫比亞大學(xué)Lappalainen實(shí)驗(yàn)室擔(dān)任博士后研究助理，從事該項(xiàng)目的研究。在2018年加入Scripps Research之后，他與Lappalainen實(shí)驗(yàn)室合作繼續(xù)進(jìn)行這項(xiàng)研究。
該團(tuán)隊(duì)致力于尋找一種更好的方法來識(shí)別生命早期出現(xiàn)的罕見遺傳病，這些疾病可能會(huì)嚴(yán)重削弱甚至危及生命。通常，對(duì)受影響的人和家庭成員應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)的基因及其轉(zhuǎn)錄本測序方法通常可以揭示原因，但前提是疾病驅(qū)動(dòng)基因突變很明顯，會(huì)導(dǎo)致蛋白質(zhì)缺失或嚴(yán)重截?cái)唷?/p>
Mohammadi說，至少有一半的罕見遺傳病具有更微妙的病因，而使用標(biāo)準(zhǔn)方法無法有效檢測出這些病。例如，突變可能會(huì)影響DNA本身不是基因但參與調(diào)節(jié)基因活性的DNA區(qū)域-從而導(dǎo)致該基因活性的失調(diào)會(huì)導(dǎo)致疾病。
Mohammadi及其同事開發(fā)的方法使用基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)來檢測母本和父本等位基因活性水平的差異。許多罕見的遺傳病是由影響基因單個(gè)等位基因的DNA突變引起的。比較同一個(gè)人在同一細(xì)胞內(nèi)具有相同分子環(huán)境的母本和父本等位基因的活性，比將一個(gè)人的基因活性與另一個(gè)人的基因活性進(jìn)行比較是一種更為敏感的方法，因?yàn)槿魏蝺蓚€(gè)人在許多其他混雜因素上都會(huì)有所不同除了其遺傳背景外，還影響基因活性。
