紐約ITHACA - 世界食品供應將變得更加安全，因為食品行業轉向高分辨率，全基因組測序 - 同時檢測特定生物體的完整DNA。這種使測序無處不在的舉措將導致始終如一地可靠地檢測沙門氏菌。
由康奈爾大學和火星食品安全中心(GFSC)的研究人員共同撰寫的一篇發表在“微生物學前沿”雜志上的論文闡明了突破。
“沙門氏菌是公共衛生和經濟影響大的食源性病原體。它是世界各地腹瀉的主要原因之一，”食品安全教授兼康奈爾食品系統研究所教授Martin Wiedmann說。“沙門氏菌可能是輕微的，也可能導致死亡，因為它的嚴重程度取決于沙門氏菌的血清型[不同的變異] - 而這正是我們試圖找到的。”
該論文描述了世界各地的食品工業應如何更頻繁地使用分子方法來分類和表征沙門氏菌。本文將舊的亞型實踐 - 一些可追溯到20世紀30年代的實踐 - 與較新的全基因組測序進行了比較，這種方法可以分析更廣泛，更完整的基因組區域。
Wiedmann說，通過這種技術，科學家可以更準確地識別特定的沙門氏菌菌株，并確定疾病爆發的起源和途徑。
例如，7月初美國食品和藥物管理局和聯邦疾病控制和預防中心(CDC)使用該技術，因為他們開始調查豬耳狗和人類之間的可疑沙門氏菌鏈接 - 由于人們處理對待。根據疾病預防控制中心的數據，當時有13個州有45例沙門氏菌病例，其中有12人住院治療。
“全基因組測序正迅速成為沙門氏菌亞型選擇的首xuan方法，”該論文的主要作者，火星食品安全中心的研究科學家Silin Tang說。“食品經常通過日益復雜的供應鏈接觸消費者，創造了許多食品安全可能受到損害的機會。近的案例強調了加強食品行業中沙門氏菌控制措施的必要性，包括使用適當的亞型工具快速準確地跟蹤污染源。 “
唐說，食品行業有機會創建生物信息學專業人才管道 - 利用軟件工具來理解生物數據 - 利用全基因組測序技術的全部潛力。
此外，Wiedmann說，本文將學術分析轉化為有用的行業應用。“這將有助于工業實施更好的方法來主動解決沙門氏菌的并發癥和復雜性，”他說。
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