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          上海遠(yuǎn)慕生物科技有限公司

          逆轉(zhuǎn)錄PCR的實(shí)驗(yàn)步驟
          點(diǎn)擊次數(shù):1239 更新時(shí)間:2023-06-29

          一、實(shí)驗(yàn)器具與材料:

          1、移液槍:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl

          2、吸頭:1ml、200μl、20μl

          3、勻漿管:5ml

          4、吸頭臺(tái):放置1ml吸頭的一個(gè),放置20μl吸頭的一個(gè)

          5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl

          6、試劑瓶:2個(gè)60ml的棕色試劑瓶(廣口,帶蓋);1個(gè)125ml的白色試劑瓶(放無(wú)水乙醇)

          7、量筒:50ml、250ml、500ml

          8、容量瓶:250ml、500ml、1000ml

          9、試管架:5ml、1.5ml、20μl

          10、鹽水瓶:250ml、500ml各2個(gè)備用,一個(gè)裝無(wú)水乙醇,另一個(gè)裝DEPC水

          11、鋁制飯盒:4個(gè)

          12、塑料小飯盒:1個(gè)

          13、大瓷缸:2個(gè)

          14、錫泊紙:一卷

          15、卷紙:2卷

          16、三角燒瓶:帶蓋,稍大

          二、實(shí)驗(yàn)器具的處理與準(zhǔn)備

          1、塑料制品:(包括槍頭、EP管、勻漿管等)
          先將DEPC水從容量瓶中倒入瓷缸中,將塑料制品逐個(gè)浸泡其中,其中小槍頭需要吸管打入DEPC水,過(guò)夜,然后高壓,再烤干備用,實(shí)驗(yàn)前將槍頭等放入吸頭臺(tái),再高壓一次(EP管)

          2、玻璃制品:泡酸過(guò)夜,沖洗干凈,蒙錫紙烤干備用(DEPC水泡)(洗凈后先泡1‰DEPC過(guò)夜,再烤干)

          3、勻漿器:(包括剪刀、鑷子)先洗凈后,再高壓(不需要泡DEPC)

          三、試劑配制:

          1、DEPC水:吸出1ml放在1000ml雙蒸水中配成1‰DEPC水,放在1000ml容量瓶中靜置4小時(shí)備用。

          2、75%乙醇:用無(wú)水乙醇 DEPC水配,然后放-20℃保存(其中DEPC水需先高壓)

          3、異丙醇:放入棕色瓶中

          4、氯仿:放入棕色瓶中

          5、瓊脂糖

          四、幾種緩沖液的配制:

          1、電泳緩沖液:
          Tris 54g
          硼酸 27.5g
          0.5M EDTA 20ml  pH8.0
          蒸溜水 1000ml
          5×TBE (貯存液)
          再將5×TBE稀釋10倍成0.5TBE就可以在電泳時(shí)使用(即工作液濃度),如取50ml貯存液 450ml水--→500ml工作緩沖液

          2、上樣緩沖液:
          0.25%溴酚藍(lán)
          0.25%二甲苯青FF
          30%甘油
          6×緩沖液,4℃保存

          五、瓊脂糖凝膠的配制:

          1、1.0%:  1.0g瓊脂糖 100ml電泳緩沖液,微波爐中火30秒至沸騰,熔化的瓊脂物冷卻至60℃時(shí)加入10mg/ml溴化乙錠2.5μl,充分混勻,將溫?zé)岬哪z倒入已置好梳子的膠膜中,在室溫下放置30-45min后現(xiàn)進(jìn)行電泳。

          2、1.5%:   同上,將瓊脂糖的量改為1.5g

          六、需購(gòu)置的Rt-PCR材料:

          Taq酶(含MgCl2 Buffer) 200u 70.00
          dNTP: 1支
          oligo(dT)15: 1 OD 40.00 promega
          M-MLV: 1支 250.00 promega (Buffer)
          RNasin: 1支 110
          -- -20℃
          DEPC 5g 110.00
          Trizol 100ml/1瓶 Invitrogen Life technologies
          -- 4℃
          Marker: 10μg 0.2μg/ml 150.00

          七、引物合成

          1. 正義:5′-CACGATGGAGGGGCCGGACTCATC-3′
          反義:5′-TAAAGACCTCTATGCCAACACAGT-3′

          2、par-4:
          正義:5′-GGGACCTCGGAACTCAAC-3′
          反義:5′-TGTATCTGCCTGGGACTG-3′

          3、退火溫度計(jì)算:
          2(A T) 4(G C)
          正反義平均數(shù),再上下波動(dòng)度(±4℃,或±5℃)

          4、引物各合成5 OD,每OD一瓶分裝好

          5、引物稀釋:
          加DEPC水量為(μl)= ? nmol / OD × 管上所標(biāo)OD數(shù)×100
          是為10p mol / μl 濃度的引物溶液

          八、PCR產(chǎn)物電泳

          先將1-10μl左右PCR產(chǎn)物,加已點(diǎn)在紙上的溴酸蘭,反復(fù)吸打混勻后進(jìn)行電泳,一般電流為10mA,電源100V,電泳30分鐘,紫外燈下觀察,滿意的結(jié)果掃描打印。

          九、幾個(gè)注意點(diǎn):

          1、逆轉(zhuǎn)錄的關(guān)鍵步驟是立即冰水浴。

          2、Rt時(shí),先打開(kāi)PCR預(yù)熱30分鐘。

          3、RNA抽提前,打開(kāi)離心機(jī)預(yù)冷。

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